СП-40 начала работать 1 октября 2012 года в Северном Ледовитом Океане. Для нее была выбрана льдина толщиной более 3 метров, шириной около 3 километров. Подобрать льдину было на этот раз очень сложно, потому что площадь ледяного покрова в сентябре 2012 года была самой маленькой за весь период регулярных наблюдений (с 1979 года).
16 членов экспедиции высадились на лед и начали работу по мониторингу природной среды в высоких широтах Арктического бассейна. Предстоял большой объем метеорологических, океанографических, аэрологических, ледовых наблюдений, исследований в области энергомассообмена в системе атмосфера-лёд-океан, а также большой комплекс специальных наблюдений. Неприятности начались почти сразу. Уже в ноябре через льдину, на которой расположилась станция, прошли трещины. Домики зимовщиков со всем оборудованием пришлось перемещать несколько раз в безопасное место, однако программу работ полярники выполняли неукоснительно. В апреле 2013 года вертолетами полярникам пополнили запасы продовольствия и топлива. Однако в середине мая базовая льдина начала колоться на небольшие фрагменты. Лагерь зимовщиков оказался разделенным разводьями на несколько частей. Ситуация становилась опасной. Было принято решение о срочной эвакуации полярников. На помощь отправился атомный ледокол «Ямал», который в сложных условиях 8 июня достиг станции. 12 июня полярники со всем оборудованием и имуществом перебрались на ледокол.
За время работы полярники продрейфовали 1673 км, выполнили 1976 метеорологических наблюдений, передали 988 сообщений для синоптиков, произвели 335 температурно-ветровых зондирований атмосферы, произвели 1423 промеров глубины на 1423 километрах пути, произвели множество других наблюдений. На пути к Большой земле экспедиция «Арктика-2013» расконсервировала базу «Мыс Баранова», расположенную на острове Большевик в архипелаге Северная Земля. 20 лет назад эта база из-за недостатка финансирования прекратила работу. На базе остались работать семь полярников, которые возродят станцию и проработают на ней все лето.
